La 14 ianuarie 2004 s-a desfăşurat adunarea parohială a bisericii „Sf.M.Mc.Gheorghe”, având pe agenda zilei o singură întrebare: transformarea parohiei în mănăstire. La adunare au participat preşedintele raionului Nicolai Caviuc şi alţi conducători ai oraşului Ungheni de asemena şi peste 400 de enoriaşi ai bisericii. Preşedintele adunării, preotul Gheorghe Matveevici, a adus la cunoştinţă că este binecuvântarea Înaltpreasfinţitului Vladimir, Mitropolitul Chişinăului şi întregii Moldove de a înfiinţa o Mănăstire. Oficialii raionului, a oraşului şi ai adunării parohiale au susţinut această frumoasă idee şi au semnat procesul verbal al adunării. În urma examinării posibilităţii de transformare a bisericii „Sf. M. Mc. Gheorghe” în mănăstirea cu binecuvântarea ÎPS Vladimir, Mitropolit al Chişinăului şi întregii Moldove.

Exarhul mănăstirilor din cuprinsul Mitropoliei Moldove, Arhimandritul Siluan Şalaru, Preşedintele Departamentului Mitropolitan Mănăstiri şi Viaţă Monahală, constată  că există toate premisile de a transofma biserica din Ungheni în Mănăstire. Astfel în acea vreme parohia dispunea de un edificiu în două niveluri. La cele două niveluri se afla cele două biserici. La primul nivel – „Sf. M. Mc. Gheorghe”. În anul 2003 s-a început a construi la al doilea nivel biserica „Sf. M. Mc.Pantelimon”. Viaţa monahală a început din 4 martie 2004, când a fost tuns în monahism, parohul bisericii, preotul Gheorghe Matveevici, cu numele de Pantelimon de către Arhimandritul Petru Musteaţă, Duhovnicul Mănăstirii „Sf. Parascheva”, actualul Episcop de Ungheni şi Nisporeni. În aceeaşi zi a fost tunsă şi ascultătoarea Iulia Staroşciuc cu numele de monahinea Gheorghia.

Biserica „Sf. M. Mc. Gheorghe” în prezent mănăstire, a fost întemeiată la 16 aprilie 2000 la sărbătoarea  Intrarea Domnului în Ierusalim. Fosta şcoală care a fost transmisă bisericii. În biserica „Sf. Gheorghe” se săvârşeau zilnic acatiste şi se citeau paraclisele Maicii Domnului, Te Deumuri pentru sănătate. La sărbători şi duminicile se săvârşeau Sfintele şi Dumnezeieştile Liturghii. După terminarea lucrărilor bisericii a fost sfinţită la 17 decembrie 2001 de sărbătoarea Sfinta Mare Muceniţă Varvara de către ÎPS Mitropolit Vladimir. A avut loc prima lirturghie arhierească cu un sobor de peste 40 de preoţi. În 2002 a fost construită clopotniţa şi sfinţită. După îndelunga boală a preotesei Ana Matveevici, la 24 aprilie 2003, a decedat şi este înmormântată pe teritoriul mănăstirii. După aceasta s-a început a săvârşi zilnic sfintele liturghii.

În 2004 a fost tunsă în monahism două ascultătoare Sandu Ecaterina – Monahinea Maria şi Alexandra Dornescu – Monahinea Ana.

În 2005 a fost tunsă în monahism două ascultătoare Svetlana Osoianu- monahinea Solomia şi Mămăligă Eugenia – monahinea Anastasia.

În 2006 au fost tunse două asultătoare: Gliga Tatiana – monahinea Elisabeta şi Raisa Rusu – monahinea Rafaela.

În 2007 a fost tunsă ascultătoarea Vera Matveevici – monahinea Varvara.

În anul 2005, la 4 ianuarie a fost sfinţită biserica de la al doilea nivel, cu hramul „Sf. M. Mc. Pantelimon” de către PS Anatolii, Episcop de Cahul şi Comrat şi Ieromonahul Pantelimon a fost ridicat în san de Egumen. Tot în anul 2005 a fost început lucrările construcţiei spaţiului locativ în număr de 22 chilii şi gardul mănăstirii.

La 5 septembrie 2005, cu binecuvântarea ÎPS Mitropolit Vladimir, Egumenul Pantelimon a fost ridicat în rangul de Arhimandrit pentru munca sârguincioasă. Lucările mănăstirii „Sf. M.Mc. Gheorghe”, au fost susţinute de Arhimandritul Petru Musteaţă şi conducătorii raionului şi a oraşului.

La 9 ianuarie 2007 a fost sfinţită biserica de la primul nivel, cu hramul „Sf. M. Mc. Gheorghe” după o reparaţie capitală, de către PS Petru, Episcop de Ungheni şi Nisporeni.

Din anul 2007 şi până în prezent Duminicile şi sărbătorile se săvârşesc două sfintel liturghii, la ora 6 dimineaţa, în biserica „Sf. M. Mc. Gheorghe”, primul nivel; a doua sfintă liturghie, în biserica „Sf. M. Mc. Pantelimon”, al doilea nivel, la ora 730.

În primăvarea anului 2007, s-a început construcţia bisericii trapeze cu două niveluri: la primul nivel – stăreţia şi la al doilea nivel – biserica trapeză, cu hramul în cinstea Maicii Domnului, sporitoarea grânelor.

În vara anului 2008 s-a finisat construcţia blocului locativ cu 22 de chilii şi a fost sfinţit de către ÎPS Mitropolit Vladimir, Duhovnicul Arhimandritul Pantelimon fiind decorat cu dreptul de a sluji cu Uşile Împărăteşti deschisă până la „Tatăl nostru…” şi monahinea Varvara a fost numită stareţa acestei mănăstiri.

În acelaşi an în luna octombrie, mănăstirea a fost înregistrată la Patriarhia Bisericii Ortodoxe Ruse din Moscova.

În anul 2010 la 6 mai, de hramul mănăstirii a fost oficiată sfânta liturghie în cinstea jubileului de 10 ani a activităţii sfântului locaş cu un sobor de preoţi, trei ierarhi în frunte cu ÎPS Vldimir, PS Sava, Episcop de Tiraspol şi Dubăsari, PS Petru, Episcop de Ungheni şi Nisporeni.

 Bisericile Mănăstirii

Biserica Sfântul Mare Mucenic Gheorghe

·        Biserica de la primul nivel a complexului monastic

·        Biserica Sfântul Mare Mucenic Pantelimon

·        Biserica trapeză în cinstea Maicii Domnului Sporitoare a  grânelor

·        Biserica Întâmpinarea Domnului

·        Biserica Acoperemântul